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如何理解泛基因组学中的从头组装法? - 知乎
image.png 从头组装、重测序、单倍型重建基因组 当有人说“我测序了一个基因组”时,从技术上讲,它可能意味着非常不同的事情。 人类是二倍体。一个完美的基因组组合应该给予我们46个 …
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什么是LNCRNA? - 知乎
4) scaffold lncRNAs(支架lncRNAs): 作为各种蛋白质复合物连接的“中心平台”,将各种蛋白复合物导向特定的基因组位置或目标基因的启动子区,调控基因表达和染色体动力学;
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FKYS 的想法: 介入医学英语系列第五期_支架相关词汇 | 支架:STENT …
介入医学英语系列第五期_支架相关词汇 | 支架:stent 取栓支架:stent retriever 裸支架:bare stent 金属支架:metal stent 药物洗脱支架:drug eluting stent 药物涂层支架:drug coated …
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有没有大佬知道联邦学习的实验怎么做呀? - 知乎
所以21、22年的很多论文,涉及到异构性、公平的联邦论文,都会cue这两篇论文,引用q-fedavg对公平性的定义。 还要加入多任务的FedMGDA+,20年ICML的SCAFFOLD在FedAvg …
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截止 2022 年,联邦学习有哪些成熟的框架或惊艳的应用? - 知乎
SCAFFOLD: Stochastic Controlled Averaging for On-Device Federated Learning Improving Federated Learning Personalization via Model Agnostic Meta Learning (NIPS 2019 Workshop) …
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如何OKU? - 知乎
scaffold直接翻译过来是脚手架。 这个概念和“测末端”有关。 简单地说,你测序的时候筛选到了20kb长的片段,但是一代和二代都测不通,只能测两端很短的序列。 这时候你有了这个20kb …
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二代测序组装完整基因组,有映射比对组装 (MAPPING ASSEMBLY) …
题主的归纳有一些问题,所以对答主有误导。组装确实分为两种,但是是de novo和reference-guided,后者基本上没有人用;我们所说的assembly的方式,通常指的是contig(最多 …
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如何将SGRNA和SGRNA SCAFFOLD连接到CAS9载体上? - 知乎
SgRNA scaffold设计:sgRNA scaffold是一个特定的RNA结构,它与SGRNA结合并促进Cas9蛋白的切劃活性通常,sgRNA scaffold的序列是已知的,并且可以在许多载体中找到。 2.准备Cas9 …
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如何设计CRISPER-DCAS9系统的GRNA,具体步骤是什么? - 知乎
tracrRNA(在CRISPR-Cas9编辑技术中被优化并命名为gRNA scaffold),它负责与Cas9结合,与重复序列具有同源性。 crRNA为引导序列,约20个碱基,具有特异性。
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SCAFFOLD 在基因中是什么? 希望能清楚点解释 - 知乎
scaffold 其实是基因组组装时的概念。涉及到的相关概念如下: reads:就是我们测序产生的短读序列,通常一代和三代的reads读长在几千到几万bp之间,二代的相对较短,平均是几十到几 …
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